Forstørrelsen av et biologisk mikroskop er vanligvis lav, og varierer fra 40x til 1000x. Dette er fordi biologiske prøver vanligvis er gjennomsiktige og krever moderat forstørrelse for å observere strukturene til celler og vev.
I et biologisk mikroskop bestemmes forstørrelsen av kombinasjonen av objektivlinsen og okularet. Vanlige objektivforstørrelser inkluderer 4x, 10x, 40x og 100x, mens okularet vanligvis har en forstørrelse på 10x. Derfor er den maksimale forstørrelsen av et typisk biologisk mikroskop 100x objektiv multiplisert med 10x okular, som tilsvarer 1000x.
Det er viktig å merke seg at forstørrelsen til et biologisk mikroskop ikke er så høy som for et elektronmikroskop fordi biologiske prøver ofte er komplekse i struktur, og observasjonsprosessen krever opprettholdelse av levedyktigheten og integriteten til prøvene. I tillegg er oppløsningen til et biologisk mikroskop også avgjørende ettersom biologiske strukturer ofte er svært små og krever høy oppløsning for å observere fine detaljer.
I visse spesialiserte applikasjoner som krever høyere forstørrelse, som patologisk forskning eller mikrokirurgi, kan okular med høyere forstørrelse (f.eks. 16x eller høyere) brukes i kombinasjon med passende okularer for å oppnå høyere forstørrelse. Imidlertid krever disse høyforstørrelsesobservasjonene vanligvis mer komplekse prøveforberedelser og mikroskopiteknikker og krever større dyktighet fra operatøren.